El Centro de laboratorios de la Universidad de Medellín, fue creado en el año de 1984 como unidad adscrita a la facultad de ingeniería civil y posteriormente en 1996, tras una reforma administrativa se convierte en Sección orientada a prestar servicios de apoyo académicos e investigativos para toda la comunidad académica.
 
Posteriormente la Sección se vincula a las actividades del sector productivo, a través de la prestación de servicios de extensión y de asesoría técnica relacionados con ensayos y pruebas de laboratorio en las áreas de ingeniería civil e ingeniería ambiental.

En 1999, la Universidad de Medellín ve la necesidad de crear un espacio que centralice los laboratorios y brinde las condiciones apropiadas para la realización de las prácticas de laboratorio de Ingeniería Civil, Ingeniería Ambiental e Ingeniería de Sistemas, es el momento en el que se decide reestructurar el Centro de laboratorios, convirtiéndolo en un espacio versátil y competitivo, que a la vez pueda apoyar a la academia en docencia, investigación y extensión. Con la ayuda de un grupo de expertos en diferentes áreas se logra modelar el proyecto dando como resultado para Febrero de 2003, el Bloque 3, Centro de laboratorios, que dispone de 3 niveles dispuestos para sus 30 laboratorios en un área total construida de 5221 m2.